RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 COMPP49747 757 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM95Q3KNT9 176 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM252Q8N6L7 170 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 DTD1Q8TEA8 209 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD5Q9GZQ3 224 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 PARP11Q9NR21 331 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 IFNA17P01571 189 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 TEX261Q6UWH6 196 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OR2T6Q8NHC8 308 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD5Q8WTS1 349 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC1AQ92747 370 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 PSENENQ9NZ42 101 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 U3KQ87 197 aa23.32■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 FAM24AA6NFZ4 105 aa23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V0E1O15342 81 aa23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA7O95182 113 aa23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO7Q9Y3I1 522 aa23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OR51B2Q9Y5P1 312 aa23.31■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 IAPPP10997 89 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF767PQ75MW2 155 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OR5B3Q8NH48 314 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF23A1L1A6 192 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 CEBPZOSA8MTT3 80 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 E7EUB6 86 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 STOML3Q8TAV4 291 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf95Q9H693 158 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00527Q9UJ94 153 aa23.3■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa23.29■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 CYTL1Q9NRR1 136 aa23.29■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 STX12Q86Y82 276 aa23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 SERTAD4Q9NUC0 356 aa23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL17Q9UF56 701 aa23.28■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 AP4M1O00189 453 aa23.27■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 SULT1A1P50225 295 aa23.27■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OR1L8Q8NGR8 309 aa23.27■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OR4F5Q8NH21 305 aa23.27■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01006Q8NI28 216 aa23.27■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GW64 132 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 IFNA7P01567 189 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 IGF1P05019 195 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 NHLH2Q02577 135 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 STPG2Q8N412 459 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF680Q8NEM1 530 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 SGMS2Q8NHU3 365 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 CGB1A6NKQ9 187 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 APELAP0DMC3 54 aa23.26■■□□□ 1.31
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ECHS1-201ENST00000368547 PRCDQ00LT1 54 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ST8SIA2Q92186 375 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HINT2Q9BX68 163 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HIPK2Q9H2X6 1198 aa23.26■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 JTBO76095 146 aa23.25■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 RPP30P78346 268 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 LFNGQ8NES3 379 aa23.25■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa23.25■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 H3BP45 60 aa23.24■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ECSCRQ19T08 205 aa23.24■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 SPANXN5Q5MJ07 72 aa23.24■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 PHYHIPLQ96FC7 376 aa23.24■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 TEX22C9J3V5 150 aa23.23■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 G3V318 75 aa23.23■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 CFDP00746 253 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 TPT1P13693 172 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 MDKP21741 143 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV41A0A0B4J266 112 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 INS-IGF2F8WCM5 200 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 SPINK9Q5DT21 86 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 UBAC2Q8NBM4 344 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 OR10W1Q8NGF6 305 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ENY2Q9NPA8 101 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ASPHD1Q5U4P2 390 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF580Q9UK33 172 aa23.22■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 ATRQ13535 2644 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 CST7O76096 145 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HBG1P69891 147 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 HBG2P69892 147 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 AKIRIN2Q53H80 203 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 BAP18Q8IXM2 172 aa23.21■■□□□ 1.31
ECHS1-201ENST00000368547 OR1S2Q8NGQ3 325 aa23.21■■□□□ 1.31
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