RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 SMPXQ9UHP9 88 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 DFFBO76075 338 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CD5P06127 495 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 FCGR3AP08637 254 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 HLA-GP17693 338 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PAFAH1B2P68402 229 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 MXD1Q05195 221 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 Q6ZRM9 215 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 RNF2Q99496 336 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.53□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 AGRNO00468 2067 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR2T8A6NH00 312 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CGB1A6NKQ9 187 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SLC17A2O00624 439 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CHEK1O14757 476 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RGS5O15539 181 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CD74P04233 296 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TFPI2P48307 235 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 Q6ZS49 121 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 BET1LQ9NYM9 111 aa7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 UPK1BO75841 260 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SPP1P10451 314 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 NPY1RP25929 384 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TALDO1P37837 337 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR2B8PP59922 312 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 STHQ8IWL8 128 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RAB3CQ96E17 227 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 V9GY05 133 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 NACAE9PAV3 2078 aa7.51□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 HLA-DQB1P01920 261 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 APOA1P02647 267 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FGF2P09038 288 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TNFSF8P32971 234 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DEFA1P59665 94 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DEFA3P59666 94 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 INSL4Q14641 139 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RGS21Q2M5E4 152 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 C12orf74Q32Q52 190 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RNF212Q495C1 297 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR10C1Q96KK4 312 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM210BQ96KR6 192 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SPATA2Q9UM82 520 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 X6R8D5 127 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.5□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IFITM5A6NNB3 132 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RAB27BO00194 218 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CTDSP2O14595 271 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGLV2-14P01704 120 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CTXN2P0C2S0 81 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DEFB131AP59861 70 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RAB11BQ15907 218 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IDNKQ5T6J7 187 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 HACD4Q5VWC8 232 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SRRQ9GZT4 340 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms