RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF124Q15973 351 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 VWC2Q2TAL6 325 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1D-33P01593 117 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-33P01594 117 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.48□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCC1Q96S66 551 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 SVBPQ8N300 66 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 ABCA1O95477 2261 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf159Q96HA4 380 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
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RABGEF1-201ENST00000284957 PRO1933Q9H354 126 aa7.46□□□□□ -1.21
RABGEF1-201ENST00000284957 PDZD2O15018 2839 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPR2Q14571 2701 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 NPFFO15130 113 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 EBI3Q14213 229 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZRG5 221 aa7.46□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 MMDQ15546 238 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 BTNL8Q6UX41 500 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 B4DSR2 109 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 AVPP01185 164 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 ADCYAP1P18509 176 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 G0S2P27469 103 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf83Q53S99 150 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.45□□□□□ -1.22
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