RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SHISA9B4DS77 424 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 SAA4P35542 130 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 CD69Q07108 199 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TEX261Q6UWH6 196 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 NECAP1Q8NC96 275 aa6.6□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 PRNTQ86SH4 94 aa6.59□□□□□ -1.35
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NANOG-201ENST00000229307 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ITGB1BP1O14713 200 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 CFHR2P36980 270 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ZNF843Q8N446 348 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 TFF1P04155 84 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 GPX1P07203 203 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 MIC13Q5XKP0 118 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.59□□□□□ -1.35
NANOG-201ENST00000229307 PAGE4O60829 102 aa6.59□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SELLP14151 372 aa6.59□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 Q6P435 159 aa6.59□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 GPHA2Q96T91 129 aa6.59□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FAM223BA6NKX1 122 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PSPNO60542 156 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 IGHV3-23P01764 117 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SFTA3P0C7M3 94 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 NHLH2Q02577 135 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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NANOG-201ENST00000229307 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 TMEM189A5PLL7 270 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 CLLU1Q5K131 121 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 NABP2Q9BQ15 211 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPQ1 181 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 CD24P25063 80 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PRCDQ00LT1 54 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PRSS8Q16651 343 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.58□□□□□ -1.36
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NANOG-201ENST00000229307 STHQ8IWL8 128 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 Q8NA96 180 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 RPRMQ9NS64 109 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PGPA6NDG6 321 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SNCGO76070 127 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PLA2G2AP14555 144 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 ASCL4Q6XD76 172 aa6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SAP30O75446 220 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 MGPP08493 103 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PAX8Q06710 450 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 OR52E5Q8NH55 327 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 RSG1Q9BU20 258 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 FHL1Q13642 323 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.57□□□□□ -1.36
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NANOG-201ENST00000229307 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 CLDN34H7C241 214 aa6.57□□□□□ -1.36
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NANOG-201ENST00000229307 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 AQP10Q96PS8 301 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SOD3P08294 240 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.57□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.56□□□□□ -1.36
NANOG-201ENST00000229307 SHISA3A0PJX4 238 aa6.56□□□□□ -1.36
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