RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636966.1

CACNA1A-232, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA1A, Length 3,938 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-232ENST00000636966 VAX2Q9UIW0 290 aa6.72□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.72□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF98A6NK75 572 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 S100PP25815 95 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 CD1BP29016 333 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.71□□□□□ -1.33
CACNA1A-232ENST00000636966 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 GOSR1O95249 250 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 DLX1P56177 255 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 UBE2G2P60604 165 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 HFEQ30201 348 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NOTCH2Q04721 2471 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 RAB5AP20339 215 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NEU1Q99519 415 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CCL19Q99731 98 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.71□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 C15orf65H3BRN8 121 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 MT-CO2P00403 227 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 OR9G9P0C7N8 305 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ICAM4Q14773 271 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 MMP23AO75900 390 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 FSTL3O95633 263 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 REG1BP48304 166 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PCP4P48539 62 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 TCF19Q9Y242 345 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC31A2O15432 143 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NPY1RP25929 384 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 RAB24Q969Q5 203 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF714Q96N38 554 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NF1P21359 2839 aa6.7□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 WNT2P09544 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 EFNA4P52798 201 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PERPQ96FX8 193 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 J3QR06 171 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NANPQ8TBE9 248 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PRNDQ9UKY0 176 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 A0A1B0GW64 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 H7BYZ3 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 DVL1O14640 695 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PAGE4O60829 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CGB3P0DN86 165 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CGB7P0DN87 165 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NECAP1Q8NC96 275 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 HARBI1Q96MB7 349 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 AGMATQ9BSE5 352 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 COLCA2A8K830 154 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CLDN34H7C241 214 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 SOX15O60248 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 PAX1P15863 534 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 IL3RAP26951 378 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 CORO2AQ92828 525 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 C5orf30Q96GV9 206 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA1A-232ENST00000636966 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.69□□□□□ -1.34
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