RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630224.2

TCF4-269, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 501 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-269	ENST00000630224	MOS	P00540	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FSHB	P01225	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C1QB	P02746	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FBP1	P09467	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	S100A10	P60903	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	UBE2K	P61086	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HES1	Q14469	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A0U1RQK1	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		L7N2F9	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	GPR137B	O60478	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	ACTL6B	O94805	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	MPC2	O95563	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LY86	O95711	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IFNA17	P01571	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		P0C879	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM11	P17152	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C4BPB	P20851	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DYNLT3	P51808	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	VAMP2	P63027	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HNF4G	Q14541	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	PLGLA	Q15195	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	AANAT	Q16613	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	CFHR4	Q92496	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-269	ENST00000630224		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224		E5RGE8	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224		K7EPK0	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224		M0QZ24	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	UPK2	O00526	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	NBR2	O15453	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SLC25A17	O43808	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SSSCA1	O60232	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	PITX3	O75364	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	KBTBD11	O94819	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	FGF2	P09038	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SLC25A4	P12235	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	MAS1L	P35410	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	OR2B8P	P59922	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	SPCS3	P61009	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-269	ENST00000630224	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms