RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 SULT1C2O00338 296 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 NDUFA4O00483 81 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 RAB3BP20337 219 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 ARPC4P59998 168 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM140Q9NV12 185 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 C21orf62Q9NYP8 219 aa9.59□□□□□ -0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 RYR1P21817 5038 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 UPK2O00526 184 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 EBAG9O00559 213 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 XRCC3O43542 346 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 OR13C7P0DN81 318 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TAS2R31P59538 309 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 Q56UQ5 140 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 DMBX1Q8NFW5 382 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 RNF2Q99496 336 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 HINT2Q9BX68 163 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 DUSP21Q9H596 190 aa9.58□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 IGLL5B9A064 214 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SSX5O60225 188 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 PTHLHP12272 177 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 NQO2P16083 231 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 FCGR2CP31995 323 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 FXYD4P59646 89 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 WT1-ASQ06250 92 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CATR1Q13166 79 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 OR51H1Q8NH63 302 aa9.57□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 C15orf62A8K5M9 175 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 K7EMT4 169 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.883e-7■■□□□ 13.1
NEDD4L-232ENST00000591579 YIF1AO95070 293 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 HPRT1P00492 218 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ADMP35318 185 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 MFAP2P55001 183 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ERVK-16P61578 105 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 AADACL3Q5VUY0 350 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 C22orf42Q6IC83 251 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 GBGT1Q8N5D6 347 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SCARB1Q8WTV0 552 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC5A7Q9GZV3 580 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SMPXQ9UHP9 88 aa9.56□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 F8W735 103 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CHEK1O14757 476 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 PPYP01298 95 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 FCER2P06734 321 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SERPINE2P07093 398 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 AQP4P55087 323 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TCTAP57738 103 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 MSMO1Q15800 293 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM17Q86X19 198 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 BEST4Q8NFU0 473 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CMTM3Q96MX0 182 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 APLNQ9ULZ1 77 aa9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 K7EIM0 57 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SCGNO76038 276 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM187Q14656 261 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 POU2AF1Q16633 256 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF773Q6PK81 442 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 COMMD9Q9P000 198 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 ETV7Q9Y603 341 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 NOTOA8MTQ0 251 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 FGF2P09038 288 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms