RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 BLOC1S1P78537 153 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MMDQ15546 238 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS8Q16651 343 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R27Q86WC6 154 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 C7orf69Q9H7B7 122 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SIGLEC9Q9Y336 463 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MTORP42345 2549 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRD5 423 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRF3 423 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PRM7 423 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RRHO14718 337 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1D-33P01593 117 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGKV1-33P01594 117 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SAA4P35542 130 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMED6Q8WW62 240 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CFHR4Q92496 578 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 REG4Q9BYZ8 158 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID1AO14497 2285 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK9Q5DT21 86 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF709Q8N972 641 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NPBQ8NG41 125 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4C12Q96R67 309 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NUDT19A8MXV4 375 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM77I1YAP6 450 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MPDU1O75352 247 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM11P17152 192 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-9P60411 292 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DLK1P80370 383 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB31Q13636 194 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 EBI3Q14213 229 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NF1P21359 2839 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FNDC10F2Z333 226 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB5BO43169 146 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO24O75426 580 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SPP1P10451 314 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TNXAQ16473 311 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC1Q9HC57 220 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO7Q9Y3I1 522 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP9Q99996 3911 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00862A6NCI5 91 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C15orf62A8K5M9 175 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CNIH1O95406 144 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PRH1P02810 166 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYGBP07316 175 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SULT1A2P50226 295 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf83Q53S99 150 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 DPPA3Q6W0C5 159 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MED9Q9NWA0 146 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX46H3BTG2 121 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CORTO00230 105 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA3O95167 84 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 S100A1P23297 94 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB2AP61019 212 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 OR1L6Q8NGR2 347 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MED13LQ71F56 2210 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP6Q13023 2319 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV40A0A0B4J280 105 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF223E7ERA6 249 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 MBP02144 154 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FBP1P09467 338 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SERF2P84101 59 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 Q96MF0 132 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CA2P00918 260 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 TGFAP01135 160 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 NMBP08949 121 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP6V0CP27449 155 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 GNB1P62873 340 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 VWC2Q2TAL6 325 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL15Q9H469 300 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa18.13■□□□□ 0.49
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