RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		J3QRE1	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AIP	O00170	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DFFB	O76075	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TOMM40	O96008	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CLEC3B	P05452	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNB3	P16520	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PSMB6	P28072	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AQP4	P55087	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PPP3R1	P63098	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD300C	Q08708	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPR176	Q14439	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNMT	Q14749	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q6ZSA8	131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF2	Q99496	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BAG2	O95816	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MT-ND4	P03905	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GTF2F2	P13984	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RANBP1	P43487	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAPT	Q8N292	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		F5H768	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		J3QLW9	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB29	O14966	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SC5D	O75845	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GLA	P06280	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRYGB	P07316	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF19	P17023	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SERPINA2	P20848	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BDKRB2	P30411	391 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPR183	P32249	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TNXA	Q16473	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		Q96MT0	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.6 ms