RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1-69P01742 117 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 MDKP21741 143 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SAA4P35542 130 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 F2RL1P55085 397 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf83Q53S99 150 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R27Q86WC6 154 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01356Q8N9X3 169 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CXorf58Q96LI9 332 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 HINT2Q9BX68 163 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3BGRL3Q9H299 93 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 UQCC1Q9NVA1 299 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TNCP24821 2201 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 NBR2O15453 112 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CA2P00918 260 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 DLK1P80370 383 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PJVKQ0ZLH3 352 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 WNK2Q9Y3S1 2297 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GW64 132 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 UMAD1C9J7I0 102 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 E7EUB6 86 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 OPN1MWP04001 364 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 COMMD7Q86VX2 200 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.21■□□□□ 0.51
CAPNS1-207ENST00000589146 TENM4Q6N022 2769 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FNDC10F2Z333 226 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM77I1YAP6 450 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 BLOC1S1P78537 153 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 Q5PR19 223 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A24Q6NUK1 477 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL15Q9H469 300 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP11Q9NR21 331 aa18.2■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 J3QLI3 93 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A1P23297 94 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 BRS3P32247 399 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN13Q12923 2485 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MMDQ15546 238 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf55Q5SWW7 151 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PVRIGQ6DKI7 326 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10W1Q8NGF6 305 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 REG4Q9BYZ8 158 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 C7orf69Q9H7B7 122 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1456Q9P272 454 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PFDN2Q9UHV9 154 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa18.19■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ACTL6BO94805 426 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNA4P05014 189 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM106CPP0CH98 169 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RUNX1Q01196 453 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 WT1-ASQ06250 92 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR83OSQ9Y284 106 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLC7A0M8Q6 106 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD2BA6NFX1 497 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX6P26367 422 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SERF2P84101 59 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TNXAQ16473 311 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 C5orf64Q2M2E5 130 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FBLN7Q53RD9 439 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 DPPA3Q6W0C5 159 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF114Q8NC26 417 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 LYPD6BQ8NI32 183 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TACC2O95359 2948 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NUDT19A8MXV4 375 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FCN1O00602 326 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SNCAP37840 140 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 HES1Q14469 280 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 HNF4GQ14541 408 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TUSC1Q2TAM9 212 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 BTNL8Q6UX41 500 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RFNGQ9Y644 331 aa18.16■□□□□ 0.5
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