RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 C8orf46Q8TAG6 207 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 P2RX4Q99571 388 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 HINT2Q9BX68 163 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 OPRK1P41145 380 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 SSX7Q7RTT5 188 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 VAX2Q9UIW0 290 aa15.2■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PTPN13Q12923 2485 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1W2PPR1 153 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 ZFP92A6NM28 416 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 GOSR1O95249 250 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PAX6P26367 422 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 AVPI1Q5T686 147 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TREML4Q6UXN2 200 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 DTX2Q86UW9 622 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.19■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CA2P00918 260 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1D-33P01593 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 IGKV1-33P01594 117 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 REG1BP48304 166 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 RAB31Q13636 194 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM170AQ8WVE7 144 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 SLC25A22Q9H936 323 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 MANBALQ9NQG1 85 aa15.18■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 HNF4GQ14541 408 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1W2PN81 502 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CHRNA7P36544 502 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 LIPFP07098 398 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 LGALS7P47929 136 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 PSMB3P49720 205 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CEBPGP53567 150 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 C2orf83Q53S99 150 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TEPPQ6URK8 271 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 CHODLQ9H9P2 273 aa15.16■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 H3BQ15 152 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 Q8N7P7 452 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 RAB24Q969Q5 203 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 MGST2Q99735 147 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 TUBA4BQ9H853 241 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 AKAP6Q13023 2319 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS3-204ENST00000575194 IGLV1-47P01700 117 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 SOD3P08294 240 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 COX6B1P14854 86 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 MYOD1P15172 320 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 TVP23CQ96ET8 276 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 FBN2P35556 2912 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 COL8A1P27658 744 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 BSXQ3C1V8 233 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 A0A1W2PPV4 95 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 IGLV2-23P01705 113 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 SPG11Q96JI7 2443 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS3-204ENST00000575194 FBP1P09467 338 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms