RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	PTH2	Q96A98	100 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	CISH	Q9NSE2	258 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	IL36B	Q9NZH7	164 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	PTPRS	Q13332	1948 aa		0.99	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123		A0A0J9YY10	115 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123		A0A1B0GX78	115 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123		F8W036	122 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	PRM2	P04554	102 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	FGF6	P10767	208 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	CDK5R1	Q15078	307 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	ELOB	Q15370	118 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	C8orf74	Q6P047	294 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		0.98	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123		A0A1B0GV50	99 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	RAB5B	P61020	215 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	KISS1	Q15726	138 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	DHFR2	Q86XF0	187 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	OPTN	Q96CV9	577 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	CMTM6	Q9NX76	183 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	MYH11	P35749	1972 aa		0.97	□□□□□ -2.25
BBS2-208	ENST00000564123	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	FBN3	Q75N90	2809 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IRGM	A1A4Y4	181 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	KCNK1	O00180	336 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IFNA5	P01569	189 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	PMP2	P02689	132 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	C1QA	P02745	245 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	FXYD2	P54710	66 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	CCL20	P78556	96 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	NDUFA5	Q16718	116 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	SLC35B4	Q969S0	331 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	DCC	P43146	1447 aa		0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM212	A6NML5	194 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	OR5G3	P0C626	314 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	RUNX1	Q01196	453 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF345	Q14585	488 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM106A	Q96A25	262 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	DERL1	Q9BUN8	251 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	TONSL	Q96HA7	1378 aa		0.95	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		0.94	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	LAMB2	P55268	1798 aa		0.94	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		0.94	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		0.94	□□□□□ -2.26
BBS2-208	ENST00000564123	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26

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