RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 OR10K2Q6IF99 312 aa6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 C5orf30Q96GV9 206 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 NEU1Q99519 415 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SLC29A1Q99808 456 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 XCL2Q9UBD3 114 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 DKK2Q9UBU2 259 aa6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 XAF1Q6GPH4 301 aa6.81□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 OR10C1Q96KK4 312 aa6.81□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.8□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 RCN1Q15293 331 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 ST8SIA2Q92186 375 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 Q96MT0 163 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 CENPOQ9BU64 300 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PPQ1 181 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PS18 150 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 J3QRK9 145 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SOCS1O15524 211 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-211ENST00000559460 SLC22A5O76082 557 aa6.79□□□□□ -1.32
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SMAD3-211ENST00000559460 HELTA6NFD8 242 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 CGB1A6NKQ9 187 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 F5H768 121 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 OGG1O15527 345 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 SERPINE2P07093 398 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MYL12AP19105 171 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 MFAP4P55083 255 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 UNC119Q13432 240 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.77□□□□□ -1.33
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