RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FBXL15	Q9H469	300 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	C16orf95	Q9H693	158 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	JMJD1C	Q15652	2540 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TEX22	C9J3V5	150 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	AP4M1	O00189	453 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CORT	O00230	105 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FCN1	O00602	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CCS	O14618	274 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CHST1	O43916	411 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CTRB1	P17538	263 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	HTR2B	P41595	481 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	BAX	Q07812	192 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FXYD3	Q14802	87 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FAM209B	Q5JX69	171 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SSX9	Q7RTT3	188 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RNF152	Q8N8N0	203 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	OR1P1	Q8NH06	330 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	NF1	P21359	2839 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379		A0A1B0GUS0	222 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PRSS46	E5RG02	174 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379		E7EUB6	86 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SIX6	O95475	246 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM50A	O95807	157 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CA2	P00918	260 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	IFNA17	P01571	189 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CD24	P25063	80 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CD83	Q01151	205 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CFHR3	Q02985	330 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	OR2F1	Q13607	317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	HNF4G	Q14541	408 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	COMMD1	Q8N668	190 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	THAP6	Q8TBB0	222 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	DTD1	Q8TEA8	209 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	ARPC1A	Q92747	370 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CHIA	Q9BZP6	476 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RBKS	Q9H477	322 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379		A0A0D9SG52	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	MSGN1	A6NI15	193 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	FAM25E	A8MYX2	175 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TRIM77	I1YAP6	450 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	WRB	O00258	174 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TAAR5	O14804	337 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	CYB5B	O43169	146 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PFDN1	O60925	122 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	IGHG4	P01861	327 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PAX6	P26367	422 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	NDP	Q00604	133 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	PLGLA	Q15195	96 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RNF41-208	ENST00000550379	TNXA	Q16473	311 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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