RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 GPR12P47775 334 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 NPBWR1P48145 328 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 H2BFSP57053 126 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 LINC00205P59089 165 aa4.95□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.95□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 HRH4Q9H3N8 390 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 NAA60Q9H7X0 242 aa4.95□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 SHPKQ9UHJ6 478 aa4.95□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.95□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 SMCO3A2RU48 225 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 LINC00473A8K010 186 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 H0Y980 276 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 J3QLI3 93 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 M0R1X1 148 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 TNFSF12O43508 249 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 MED6O75586 246 aa4.94□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 CT45A5P0DMU8 189 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 CT45A7P0DMV0 189 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 HKR1P10072 659 aa4.94□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.94□□□□□ -1.62
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CMTM1-220ENST00000534143 MITD1Q8WV92 249 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 LHX4Q969G2 390 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 TP53RKQ96S44 253 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 S1PR3Q99500 378 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 NABP2Q9BQ15 211 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 PARP11Q9NR21 331 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 DPM3Q9P2X0 92 aa4.94□□□□□ -1.62
CMTM1-220ENST00000534143 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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