RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 H7C2Y5 167 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 M0QZ24 198 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SLC31A2O15432 143 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 KCNAB3O43448 404 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CCNKO75909 580 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE7O76087 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 HPRT1P00492 218 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 HRASP01112 189 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE12FP0CL80 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE12GP0CL81 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE12IP0CL82 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 UCP1P25874 307 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 DUTP33316 252 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 ZNF137PP52743 207 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FGL1Q08830 312 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE1Q13065 139 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GAGE4Q13068 117 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM187Q14656 261 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SP6Q3SY56 376 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MOB3BQ86TA1 216 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 OR8H3Q8N146 312 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM230Q96A57 120 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MALSU1Q96EH3 234 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM56Q96MV1 263 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 ZFP57Q9NU63 452 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 COMMD9Q9P000 198 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.85□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GVG6 124 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GOSR2O14653 212 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FCGR3BO75015 233 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SNAPC5O75971 98 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 CDS2O95674 445 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 IGLV1-47P01700 117 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 NQO2P16083 231 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 VDAC1P21796 283 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 BRS3P32247 399 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LPAR6P43657 344 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 AKR1C2P52895 323 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SCGB2A2Q13296 93 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SMCO1Q147U7 214 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FCN2Q15485 313 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 PDPNQ86YL7 162 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FAM219AQ8IW50 185 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LRTM2Q8N967 370 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 NANPQ8TBE9 248 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 TP53RKQ96S44 253 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-210ENST00000512194 A0A0B4J293 547 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ODF3BA8MYP8 253 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 NPFFO15130 113 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-69P01742 117 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 RLN2P04090 185 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 FAM106CPP0CH98 169 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 PET100P0DJ07 73 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 MMP9P14780 707 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 HLA-GP17693 338 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 HNF1AP20823 631 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 LGALS7P47929 136 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 ODF3L1Q8IXM7 274 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-210ENST00000512194 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.83□□□□□ -1.48
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