RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-208	ENST00000497700	IFITM2	Q01629	132 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	OR8H3	Q8N146	312 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	GPR146	Q96CH1	333 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	COMMD9	Q9P000	198 aa		14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		A0A0G2JRQ6	117 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		H0YJW9	148 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	APOA2	P02652	100 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		P0C879	139 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	AKR1C2	P52895	323 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	RTL8B	Q17RB0	113 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		14	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		A0A1B0GU03	582 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	CRYZL1	O95825	349 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	KRAS	P01116	189 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	MC5R	P33032	325 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	G6PC	P35575	357 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	FGL1	Q08830	312 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		Q8N9W7	124 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	AP4M1	O00189	453 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	NQO2	P16083	231 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	C4BPB	P20851	252 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	PSMB6	P28072	239 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	EBI3	Q14213	229 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		Q6ZRM9	215 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		Q8N6K4	173 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700		H7C2Y5	167 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	PITX3	O75364	302 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	MPC2	O95563	127 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	HRAS	P01112	189 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	ERVK-16	P61578	105 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	ATP6V1G1	O75348	118 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	SLC25A4	P12235	298 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	RAB32	Q13637	225 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ELL3-208	ENST00000497700	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	ID3	Q02535	119 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	RHOV	Q96L33	236 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	HSPB11	Q9Y547	144 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700		H0YIZ8	118 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700		K7EPK0	472 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	SHOX	O15266	292 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	LYL1	P12980	280 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	F2RL1	P55085	397 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	CFHR3	Q02985	330 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	FOXE3	Q13461	319 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ELL3-208	ENST00000497700	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18

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