RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTF1Q16619 201 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF785A8K8V0 405 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C3orf84H3BNL1 204 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GABARAPO95166 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SERPINE2P07093 398 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CBLN1P23435 193 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GUCA2BQ16661 112 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 M0QYG6 137 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFNA6P05013 189 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR183P32249 361 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UCP3P55916 312 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD81P60033 236 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WT1-ASQ06250 92 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLET1Q6UQ28 207 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CADM3Q8N126 398 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEURL2Q9BR09 285 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRNDQ9UKY0 176 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TPPPO94811 219 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HAGHQ16775 308 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAX1Q8IWV1 398 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSC22D3Q99576 134 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLK11Q9UBX7 282 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PGAM2P15259 253 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR141Q7Z602 305 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR52I2Q8NH67 350 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MUC7Q8TAX7 377 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM56Q96MV1 263 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PALMDQ9NP74 551 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM213A2RRL7 107 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD7P09564 240 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TM4SF20Q53R12 229 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR5B3Q8NH48 314 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR4A16Q8NH70 328 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA25Q9BR10 227 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A8MWP6 167 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CD3DP04234 171 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB125Q8N687 156 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEC22AQ96IW7 307 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CITED4Q96RK1 184 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABHD1Q96SE0 405 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MLXQ9UH92 298 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UFC1Q9Y3C8 167 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR2T8A6NH00 312 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DBX1A6NMT0 343 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C15orf61A6NNL5 157 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR11H12B2RN74 326 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGS5O15539 181 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TGOLN2O43493 480 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MFAP2P55001 183 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV1-39P01597 117 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV1D-39P04432 117 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LYL1P12980 280 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PI3P19957 117 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ALDH3B2P48448 385 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MARC2Q969Z3 335 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms