RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GAFA1Q96PS6 74 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR4F4Q96R69 305 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.9□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 HCFC1P51610 2035 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf65H3BRN8 121 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 S1PR2O95136 353 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 DDTP30046 118 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 G6PCP35575 357 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SSX2Q16385 188 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 OR1L1Q8NH94 360 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM18Q96B42 140 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 JPT1Q9UK76 154 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPV4 95 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 XKRY2A2RUG3 117 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 MARCH11A6NNE9 402 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf94C9JXX5 98 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 FCN3O75636 299 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GOSR1O95249 250 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 MT-CO2P00403 227 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1D-33P01593 117 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1-33P01594 117 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GZMHP20718 246 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 OPRK1P41145 380 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GABRA2P47869 451 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SPCS3P61009 180 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 CORO2AQ92828 525 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 CLN8Q9UBY8 286 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PPIAL4DF5H284 164 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RAMP3O60896 148 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 HPRT1P00492 218 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RNF224P0DH78 156 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IRF2P14316 349 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PAX1P15863 534 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 COL8A2P25067 703 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 CD1BP29016 333 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GAMTQ14353 236 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IQCJQ1A5X6 159 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 R3HDM4Q96D70 268 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ROS1P08922 2347 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087X0M5 115 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GX30 115 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPQ1 181 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 A6NNC1 897 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf62A8K5M9 175 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 C17orf98A8MV24 154 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 FNDC10F2Z333 226 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ITGB1BP1O14713 200 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PAGE4O60829 102 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 CXorf1O96002 111 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 AMBPP02760 352 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SELLP14151 372 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GPR12P47775 334 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RAB7AP51149 207 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 RAB4BP61018 213 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 HNF4GQ14541 408 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 Q3ZCU0 254 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 SSX9Q7RTT3 188 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms