RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 RFESDQ8TAC1 157 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ENKURQ8TC29 256 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 UFD1Q92890 307 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB3CQ96E17 227 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CITED1Q99966 193 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CENPOQ9BU64 300 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TM2D1Q9BX74 207 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51E2Q9H255 320 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C16orf95Q9H693 158 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF702PQ9H963 129 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CALYQ9NYX4 217 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 FUOMA2VDF0 154 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 AIPO00170 330 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAGEB3O15480 346 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PDCD6O75340 191 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRYZL1O95825 349 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PAHP00439 452 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GTF2F2P13984 249 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNG10P50151 68 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SSTP61278 116 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SCGB2A2Q13296 93 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HERPUD1Q15011 391 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HMGN3Q15651 99 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 LTC4SQ16873 150 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HES5Q5TA89 166 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C22orf42Q6IC83 251 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB12Q6IQ22 244 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8N2B8 174 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MALSU1Q96EH3 234 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C5orf30Q96GV9 206 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 C16orf74Q96GX8 76 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 KLK12Q9UKR0 248 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSG11Q9UQ72 335 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.22□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 SORL1Q92673 2214 aa3.21□□□□□ -1.89
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFITM5A6NNB3 132 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCRL2O00421 344 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 MFNGO00587 321 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCSO14618 274 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 ORC5O43913 435 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 HBZP02008 142 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 FUT3P21217 361 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 GALP22466 123 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 GADD45AP24522 165 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 NFYBP25208 207 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 PSMB9P28065 219 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 HTR1DP28221 377 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 KCNJ3P48549 501 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 MFAP2P55001 183 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNG2P59768 71 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 BLCAPP62952 87 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR176Q14439 515 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 NEDD8Q15843 81 aa3.21□□□□□ -1.9
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms