RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 MXD1Q05195 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TMEM17Q86X19 198 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 BEST4Q8NFU0 473 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RNF183Q96D59 192 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DNAH2Q9P225 4427 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PKHD1P08F94 4074 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TSPAN4O14817 238 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PPYP01298 95 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-48P01763 117 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 GALP22466 123 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PSMB9P28065 219 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ADMP35318 185 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZWC4 215 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 STPG3Q8N7X2 389 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 MARC2Q969Z3 335 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.26□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DBX1A6NMT0 343 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SDC2P34741 201 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RANBP1P43487 201 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ARL6IP1Q15041 203 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 HOGA1Q86XE5 327 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 OR4A5Q8NH83 315 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RNF2Q99496 336 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CENPOQ9BU64 300 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 FBXL17Q9UF56 701 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 K7EIM0 57 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SERPINE2P07093 398 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 NQO2P16083 231 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R31P59538 309 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IDNKQ5T6J7 187 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.24□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 UBE2CO00762 179 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.093e-25■■■■■ 34.8
ACTB-209ENST00000473257 HPRT1P00492 218 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KRASP01116 189 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RLN1P04808 185 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 GNRHRP30968 328 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 G6PCP35575 357 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 LPAR6P43657 344 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 POU2AF1Q16633 256 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 Q56UQ5 140 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 SPARTQ8N0X7 666 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.23□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 OR4C46A6NHA9 309 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA4O00483 81 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CHEK1O14757 476 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 YIF1AO95070 293 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 PMP2P02689 132 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CTSGP08311 255 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 TGFBR1P36897 503 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 RFX2P48378 723 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 CATR1Q13166 79 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 LILRB2Q8N423 598 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-209ENST00000473257 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.22□□□□□ -1.09
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