RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	LYPD6	Q86Y78	171 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		Q8N6K4	173 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CALY	Q9NYX4	217 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		J3QT63	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PRKACA	P17612	351 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NFYB	P25208	207 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HSD11B1	P28845	292 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CD34	P28906	385 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	WNT4	P56705	351 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ESRRG	P62508	458 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SELENOW	P63302	87 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RUNX1	Q01196	453 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GRK1	Q15835	563 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MNS1	Q8NEH6	495 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LZIC	Q8WZA0	190 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RASL12	Q9NYN1	266 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LINC01619	G3V211	115 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TOR1A	O14656	332 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PPP1R2P9	O14990	202 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF682	O95780	498 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HAND1	O96004	215 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SERPINA1	P01009	418 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CD7	P09564	240 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SPI1	P17947	270 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GABRR1	P24046	479 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GNG10	P50151	68 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HCCS	P53701	268 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TAS2R19	P59542	299 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RAB11A	P62491	216 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	VSNL1	P62760	191 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PITPNA	Q00169	270 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DEFA5	Q01523	94 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	AES	Q08117	197 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TMED1	Q13445	227 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RAB11B	Q15907	218 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LTC4S	Q16873	150 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RPE	Q96AT9	228 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TEAD3	Q99594	435 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RARRES2	Q99969	163 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RGCC	Q9H4X1	137 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAT1	Q14517	4588 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM120B	A0PK00	339 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RBM17-208	ENST00000467080	NUPR2	A6NF83	97 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RBM17-208	ENST00000467080	PANO1	I0J062	215 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RBM17-208	ENST00000467080	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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