RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466352.5

PRKCZ-206, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-206	ENST00000466352	HMSD	A8MTL9	139 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	IGLV2-23	P01705	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	IGF1	P05019	195 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	FGF2	P09038	288 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	CACNG5	Q9UF02	275 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	MED6	O75586	246 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	SPDEF	O95238	335 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	LY86	O95711	162 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TSPAN15	O95858	294 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	CRYGB	P07316	175 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	LYL1	P12980	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	CX3CL1	P78423	397 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	RAB32	Q13637	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	AARD	Q4LEZ3	155 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352		Q6ZRM9	215 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	NOTCH1	P46531	2555 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRKCZ-206	ENST00000466352	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352		G3V3Q6	166 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	SLC25A17	O43808	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	DEDD	O75618	318 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	UBE2K	P61086	200 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	SLC35B1	P78383	322 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	CFHR3	Q02985	330 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PLGLA	Q15195	96 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352		Q5BKY6	102 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF546	Q86UE3	836 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	COMMD1	Q8N668	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PRND	Q9UKY0	176 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352		E5RGE8	158 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352		G3V318	75 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352		K7EPK0	472 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	WRB	O00258	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	UPK2	O00526	184 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	SCGB1D2	O95969	90 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	OPN1MW	P04001	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	S100A10	P60903	97 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	NDP	Q00604	133 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	TEX38	Q6PEX7	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	RAB40C	Q96S21	281 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PRKCZ-206	ENST00000466352	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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