RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439578.5

SAR1B-202, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAR1B, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1B-202ENST00000439578 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 FAM25EA8MYX2 175 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 H3BUA1 57 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 MED6O75586 246 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 IGKV1-5P01602 117 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ELANEP08246 267 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR9G9P0C7N8 305 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SNCAP37840 140 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 PROK1P58294 105 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 Q6ZS46 218 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF429Q86V71 674 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SLA2Q9H6Q3 261 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.43□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NUDT19A8MXV4 375 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 APELAP0DMC3 54 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SLC25A6P12236 298 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SPCS3P61009 180 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NDPQ00604 133 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 PRCDQ00LT1 54 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 FOXE3Q13461 319 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF329Q86UD4 541 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 GPR146Q96CH1 333 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 JMJD1CQ15652 2540 aa8.42□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0G2JLM5 398 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 LINC01548A6NM66 108 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 G3V318 75 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ST8SIA3O43173 380 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 LY86O95711 162 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TRGV3P03979 118 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TPPP2P59282 170 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NOXA1Q86UR1 476 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR5T1Q8NG75 326 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR52E5Q8NH55 327 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ZNF747Q9BV97 191 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ZFP57Q9NU63 452 aa8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 HMX3A6NHT5 357 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 ADAP1O75689 374 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 SCGB1D2O95969 90 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 IGHG4P01861 327 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 OR13C7P0DN81 318 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 PSMB6P28072 239 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TATDN3Q17R31 274 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NMSQ5H8A3 153 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.4□□□□□ -1.06
SAR1B-202ENST00000439578 NF1P21359 2839 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0B4J293 547 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 A0A0G2JRQ6 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 TEX22C9J3V5 150 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 M0QZ24 198 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 CORTO00230 105 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 GOSR2O14653 212 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 SCGB2A1O75556 95 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 NXPH3O95157 252 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 REG1AP05451 166 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 P0C879 139 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 MYOD1P15172 320 aa8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SAR1B-202ENST00000439578 HTR2BP41595 481 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms