RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5B12	Q96R08	314 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TBX5	Q99593	518 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TUBA4B	Q9H853	241 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MED4	Q9NPJ6	270 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GNG8	Q9UK08	70 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PPE3	182 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DAPL1	A0PJW8	107 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SNTN	A6NMZ2	147 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LINC01619	G3V211	115 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		H0Y980	276 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		H0YJX3	145 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		I3L521	148 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PRKY	O43930	277 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1D-12	P01611	117 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ISG15	P05161	165 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CGB3	P0DN86	165 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CGB7	P0DN87	165 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PSMB8	P28062	276 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SSTR5	P35346	364 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB9A	P51151	201 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PITPNA	Q00169	270 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMED1	Q13445	227 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MMD	Q15546	238 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KISS1	Q15726	138 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ELP2	Q6IA86	826 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KCTD9	Q7L273	389 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SPATA24	Q86W54	205 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LYPD6	Q86Y78	171 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	STX19	Q8N4C7	294 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LINC00311	Q8N616	119 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		Q8N6K4	173 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C7orf33	Q8WU49	177 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ARL11	Q969Q4	196 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	COQ2	Q96H96	371 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SPACA5	Q96QH8	159 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GPER1	Q99527	375 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	S100A13	Q99584	98 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GNG12	Q9UBI6	72 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KIF25	Q9UIL4	384 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.54	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		G3V2T6	193 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		G3V318	75 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	AIP	O00170	330 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NBR2	O15453	112 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SULT1B1	O43704	296 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ORC5	O43913	435 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FKBP6	O75344	327 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	INS	P01308	110 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HTR1A	P08908	422 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB3A	P20336	220 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CALB2	P22676	271 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DAP	P51397	102 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CDK5R1	Q15078	307 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PLGLA	Q15195	96 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TATDN3	Q17R31	274 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		Q3ZCU0	254 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TP53I3	Q53FA7	332 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	C6orf183	Q5T699	404 aa		2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SSX6	Q7RTT6	188 aa		2.53	□□□□□ -2

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