RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 AJUBAQ96IF1 538 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5SQ99766 215 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 GINS3Q9BRX5 216 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL17Q9UF56 701 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CR1P17927 2039 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRD5 423 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRF3 423 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PRM7 423 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FGF16O43320 207 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CST7O76096 145 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CNIH1O95406 144 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 NPY1RP25929 384 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SERF2P84101 59 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 BSXQ3C1V8 233 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RNF141Q8WVD5 230 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RITA1Q96K30 269 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf62A8K5M9 175 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 UMAD1C9J7I0 102 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM77I1YAP6 450 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 KCNAB3O43448 404 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 NXPH3O95157 252 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA4P05014 189 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 BLOC1S1P78537 153 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 DLK1P80370 383 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB2A2Q13296 93 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RAB31Q13636 194 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TNXAQ16473 311 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 VWC2Q2TAL6 325 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CLLU1Q5K131 121 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 LILRB2Q8N423 598 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF114Q8NC26 417 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 HINT2Q9BX68 163 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT19A8MXV4 375 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 MBP02144 154 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SPP1P10451 314 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 HNF4GQ14541 408 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF709Q8N972 641 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 OR1P1Q8NH06 330 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 OR5R1Q8NH85 324 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 OR4C12Q96R67 309 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SSX3Q99909 188 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL15Q9H469 300 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 ABCA1O95477 2261 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 H3BP45 60 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 CA2P00918 260 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FSHBP01225 129 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 HLA-DRB1P01911 266 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 OR13C7P0DN81 318 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SULT1A2P50226 295 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 FXYD3Q14802 87 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N9W7 124 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms