RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 CTSZQ9UBR2 303 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C9JQL5 133 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RNF223E7ERA6 249 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CYB5BO43169 146 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SIAH2O43255 324 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 KBTBD11O94819 623 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PLAUP00749 431 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV2-70P01814 119 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CCL3L1P16619 93 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FGF7P21781 194 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CD1BP29016 333 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RAB13P51153 203 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 C17orf50Q8WW18 174 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RAB1CQ92928 201 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LHX4Q969G2 390 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TUBA4BQ9H853 241 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 H0YJW9 148 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 TSPAN4O14817 238 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CD5LO43866 347 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 FCN3O75636 299 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PAX6P26367 422 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 LGALS7P47929 136 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CCL20P78556 96 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PRCDQ00LT1 54 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RHEBQ15382 184 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 OR8B2Q96RD0 313 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-204ENST00000424089 CR1P17927 2039 aa8.15□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 DYSFO75923 2080 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS46E5RG02 174 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 IFNA4P05014 189 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 COL8A2P25067 703 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 NPY1RP25929 384 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 OPRK1P41145 380 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RAB31Q13636 194 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ICAM4Q14773 271 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 UTF1Q5T230 341 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 DTX2Q86UW9 622 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 NABP2Q9BQ15 211 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RFNGQ9Y644 331 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 ABCA1O95477 2261 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CADP27708 2225 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 USF3Q68DE3 2245 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PN81 502 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 BCL2P10415 239 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNA7P36544 502 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 NPBWR1P48145 328 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf83Q53S99 150 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.13□□□□□ -1.11
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