RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.79□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4A5Q8NH83 315 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPHA2Q96T91 129 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BET1LQ9NYM9 111 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.78□□□□□ -0.84
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM235A6NFC5 223 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2CO00762 179 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLET1Q6UQ28 207 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFB11Q9NX14 153 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.77□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN4O14817 238 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGOLN2O43493 480 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFSF12O43508 249 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNG2P59768 71 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2B8PP59922 312 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF183Q96D59 192 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THYN1Q9P016 225 aa9.76□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM30A4D0T7 59 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX5O60225 188 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSMO1Q15800 293 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf42Q6IC83 251 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STPG3Q8N7X2 389 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SECTM1Q8WVN6 248 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCL28Q9NRJ3 127 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSR3Q9UNL2 185 aa9.75□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEDDO75618 318 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGNO76038 276 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBR1P36897 503 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R31P59538 309 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCFD2Q8NI22 146 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100ZQ8WXG8 99 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BORCS5Q969J3 196 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTOA8MTQ0 251 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPK2O00526 184 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S1PR2O95136 353 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPA2P15927 270 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NQO2P16083 231 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARPC4P59998 168 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATR1Q13166 79 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF846Q147U1 533 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POU2AF1Q16633 256 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB34Q8NCN2 500 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT14Q96FL9 552 aa9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T8A6NH00 312 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4C46A6NHA9 309 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT1C2O00338 296 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB5BO43169 146 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPRT1P00492 218 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPYP01298 95 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGF2P09038 288 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCGR2CP31995 323 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEST4Q8NFU0 473 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM140Q9NV12 185 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA4O00483 81 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTHLHP12272 177 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.72□□□□□ -0.85
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.72□□□□□ -0.85
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