RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TBX15Q96SF7 602 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 VENTXO95231 258 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 FGF7P21781 194 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 LGALS4P56470 323 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 SSX2Q16385 188 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 CFHR4Q92496 578 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 LINC00052Q96N35 136 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.41■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 AGPAT2O15120 278 aa15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 HNF4GQ14541 408 aa15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 DPPA3Q6W0C5 159 aa15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.4■□□□□ 0.06
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PN81 502 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CGB1A6NKQ9 187 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ZP3P21754 424 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PAX6P26367 422 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 COL8A1P27658 744 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA7P36544 502 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SNCAP37840 140 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 UBE2E1P51965 193 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 DLK1P80370 383 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PRSS8Q16651 343 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 BSXQ3C1V8 233 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ZNF787Q6DD87 383 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MMD2Q8IY49 270 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 BPIFCQ8NFQ6 507 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.39■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SMCO3A2RU48 225 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 OOSP1A8MZH6 123 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ACTL6BO94805 426 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 H2AFB1P0C5Y9 115 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 DSCR9P59020 149 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 AKR1C1Q04828 323 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 C2orf83Q53S99 150 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 VSIRQ9H7M9 311 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 RPRMQ9NS64 109 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 FBN2P35556 2912 aa15.38■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GW64 132 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 IGKV1D-33P01593 117 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 IGKV1-33P01594 117 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TREML4Q6UXN2 200 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ZNF709Q8N972 641 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 C17orf50Q8WW18 174 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MOSP00540 346 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CD24P25063 80 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MAS1LP35410 378 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 WT1-ASQ06250 92 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 COMMD1Q8N668 190 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 FBXL15Q9H469 300 aa15.37■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CENPEQ02224 2701 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GV50 99 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PAX8Q06710 450 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TNXAQ16473 311 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.36■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MPDU1O75352 247 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MMDQ15546 238 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 MALSU1Q96EH3 234 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TREM1Q9NP99 234 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 OR13C7P0DN81 318 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 COMPP49747 757 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PLGLAQ15195 96 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 ACSM6Q6P461 480 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 LFNGQ8NES3 379 aa15.35■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 PLXNB1O43157 2135 aa15.34■□□□□ 0.05
UPP1-201ENST00000331803 TMEM218A2RU14 115 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms