RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 HLA-DMBP28068 263 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 QRFPP83859 136 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 ARFRP1Q13795 201 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 C22orf42Q6IC83 251 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 OR2A7Q96R45 310 aa7.58□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.58□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 E7EUB6 86 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 K7EMT4 169 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 TGOLN2O43493 480 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 UCHL1P09936 223 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 MIFP14174 115 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 AREGP15514 252 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 RANBP1P43487 201 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 MZT2AQ6P582 158 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 TMEM203Q969S6 136 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.57□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 C15orf61A6NNL5 157 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 NDUFA4O00483 81 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 CYB5BO43169 146 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 FCGR3BO75015 233 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CD3GP09693 182 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CD37P11049 281 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 TMEM50BP56557 158 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 ZNF124Q15973 351 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 IGSF11Q5DX21 431 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 Q8N1X5 172 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 GINS4Q9BRT9 223 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 PECRQ9BY49 303 aa7.56□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 KCNK15Q9H427 330 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 SCAND1P57086 179 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 Q6ZR54 194 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 KCTD9Q7L273 389 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 SSX9Q7RTT3 188 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 OR4S2Q8NH73 311 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CMTM3Q96MX0 182 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CCDC32Q9BV29 185 aa7.55□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 C15orf62A8K5M9 175 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 NOTOA8MTQ0 251 aa7.54□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 IFNA17P01571 189 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 REG1AP05451 166 aa7.54□□□□□ -1.2
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USP41-201ENST00000292729 RAB3BP20337 219 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 PPP5CP53041 499 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 P2RY14Q15391 338 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 CCDC190Q86UF4 302 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 MFSD4AQ8N468 514 aa7.54□□□□□ -1.2
USP41-201ENST00000292729 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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