RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 PLXNB1O43157 2135 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SPG11Q96JI7 2443 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 FGF16O43320 207 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MAS1LP35410 378 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SULT1A2P50226 295 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RUNX1Q01196 453 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 MALSU1Q96EH3 234 aa6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 FBXL15Q9H469 300 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.66□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 SMCO3A2RU48 225 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RRHO14718 337 aa6.65□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 TMEM11P17152 192 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 GATA3P23771 443 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CD24P25063 80 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 BRS3P32247 399 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SNCAP37840 140 aa6.65□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 GNB1P62873 340 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 Q6ZRG5 221 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.65□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.65□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 MBD6Q96DN6 1003 aa6.65□□□□□ -1.34
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COPS4-201ENST00000264389 IGHV1-69P01742 117 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 FAM157CP0CG43 387 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 FGF7P21781 194 aa6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 VWC2Q2TAL6 325 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 Q96MF0 132 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 A6NJY4 79 aa6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 BLOC1S1P78537 153 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 ZNF616Q08AN1 781 aa6.64□□□□□ -1.35
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COPS4-201ENST00000264389 C2orf83Q53S99 150 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 NPBQ8NG41 125 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 GGACTQ9BVM4 153 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 REG4Q9BYZ8 158 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.64□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.63□□□□□ -1.35
COPS4-201ENST00000264389 TENM4Q6N022 2769 aa6.63□□□□□ -1.35
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