RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-GP17693 338 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZS46 218 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FAM219AQ8IW50 185 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR51J1Q9H342 316 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF702PQ9H963 129 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PARP11Q9NR21 331 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CACNG5Q9UF02 275 aa6.74□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C7orf66A4D0T2 115 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01548A6NM66 108 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 DBX1A6NMT0 343 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf61A6NNL5 157 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FAM25EA8MYX2 175 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GOSR2O14653 212 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 KCNAB3O43448 404 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NXPH3O95157 252 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IGHG2P01859 326 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MAS1LP35410 378 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CX3CL1P78423 397 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NDPQ00604 133 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FXYD3Q14802 87 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NMSQ5H8A3 153 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZRM9 215 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZSV7 163 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CADM3Q8N126 398 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR1S1Q8NH92 325 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PRNDQ9UKY0 176 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.73□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf51A6NDU8 294 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 MPTX1A8MV57 137 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V0E1O15342 81 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ST8SIA3O43173 380 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TSPAN9O75954 239 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FGF2P09038 288 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 APELAP0DMC3 54 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SMCO1Q147U7 214 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC1AQ92747 370 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 OR10C1Q96KK4 312 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SPIN2AQ99865 258 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 HINT2Q9BX68 163 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.72□□□□□ -1.33
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GU03 582 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MSGN1A6NI15 193 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 E7EUB6 86 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 AP4M1O00189 453 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFA7O95182 113 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SIX6O95475 246 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA17P01571 189 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 HKR1P10072 659 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A6P12236 298 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ECSCRQ19T08 205 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 SPINK9Q5DT21 86 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZNX1 250 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF429Q86V71 674 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N2B8 174 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR4F5Q8NH21 305 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 OR5B3Q8NH48 314 aa6.71□□□□□ -1.34
SGMS1-211ENST00000626236 MED28Q9H204 178 aa6.71□□□□□ -1.34
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