RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB7AP51149 207 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RND2P52198 227 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSPH1Q075Z2 132 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PMS2P11Q13670 270 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSXQ3C1V8 233 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPV4 95 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C15orf61A6NNL5 157 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf97H3BN30 126 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGC1P0CF51 173 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXA5P20719 270 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADIPOQQ15848 244 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOB3BQ86TA1 216 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM250H0YL14 139 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRRG2O14669 202 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCN3O75636 299 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM6P0DI80 62 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRF2P14316 349 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCL3L1P16619 93 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFSF4P23510 183 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52E5Q8NH55 327 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.67□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CA2P00918 260 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THBDP07204 575 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CT45A6P0DMU7 189 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CT45A5P0DMU8 189 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CT45A7P0DMV0 189 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8NA96 180 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCL17Q92583 94 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MANBALQ9NQG1 85 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOD3P08294 240 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REG1BP48304 166 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFB4O95168 129 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDGF1P3P51864 188 aa9.66□□□□□ -0.86
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GFRALQ6UXV0 394 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.66□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPY1RP25929 384 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THBS3P49746 956 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNB1P62873 340 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MLANAQ16655 118 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIRC2Q96SL1 478 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.65□□□□□ -0.86
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED13LQ71F56 2210 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C17orf100A8MU93 164 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H7BYZ3 331 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHRNA7P36544 502 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OPRK1P41145 380 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR2DS2P43631 304 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NEUROG1Q92886 237 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAB2Q9UQC2 676 aa9.65□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPQ1 181 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RD3LP0DJH9 198 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B2MP61769 119 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF114Q8NC26 417 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUP37Q8NFH4 326 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GGACTQ9BVM4 153 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIOXQ9UGB7 285 aa9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00587B1AMM8 73 aa9.64□□□□□ -0.87
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