RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589864.1

TNNI3-208, Transcript of troponin I3, cardiac type, human

TSL 2

Gene TNNI3, Length 525 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNI3-208	ENST00000589864	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	THYN1	Q9P016	225 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A1B0GVY2	172 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	CGB1	A6NKQ9	187 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864		J3QRK9	145 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	MFNG	O00587	321 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	ARL6IP5	O75915	188 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	HRAS	P01112	189 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	IGLV2-14	P01704	120 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	REG1A	P05451	166 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	GNB3	P16520	340 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	CRHBP	P24387	322 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	TALDO1	P37837	337 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM203	Q969S6	136 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	C8orf4	Q9NR00	106 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864		V9GY05	133 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	IGLL5	B9A064	214 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	RAB27B	O00194	218 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	TGOLN2	O43493	480 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	CTXN2	P0C2S0	81 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	HLA-G	P17693	338 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	MFAP2	P55001	183 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	PLA2G7	Q13093	441 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	OR4A5	Q8NH83	315 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TNNI3-208	ENST00000589864	C11orf94	C9JXX5	98 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864		K7EMT4	169 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	GNAO1	P09471	354 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	RPA2	P15927	270 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	TRAM1	Q15629	374 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	MFSD4A	Q8N468	514 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	UFD1	Q92890	307 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	BET1L	Q9NYM9	111 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864		A0A075B6Q4	140 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	NDUFA4	O00483	81 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	DTYMK	P23919	212 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	OR2B8P	P59922	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ATP6V0B	Q99437	205 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SPATA2	Q9UM82	520 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CYB5B	O43169	146 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	XRCC3	O43542	346 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	RAB6A	P20340	208 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ARL6IP1	Q15041	203 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	HES5	Q5TA89	166 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ETV7	Q9Y603	341 aa		12	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	DEFB4A	O15263	64 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	TMEM187	Q14656	261 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF124	Q15973	351 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	FGF2	P09038	288 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	RNF2	Q99496	336 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	UPK2	O00526	184 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	CHEK1	O14757	476 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	SERPINE2	P07093	398 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TNNI3-208	ENST00000589864	FABP5	Q01469	135 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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