RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 SSX9Q7RTT3 188 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR4A5Q8NH83 315 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RNF183Q96D59 192 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPATA2Q9UM82 520 aa7.33□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 CGB1A6NKQ9 187 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYOD1P15172 320 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB3BP20337 219 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYL9P24844 172 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPR183P32249 361 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 PLET1Q6UQ28 207 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 STPG3Q8N7X2 389 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 BET1LQ9NYM9 111 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TSPAN4O14817 238 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR2B8PP59922 312 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPHA2Q96T91 129 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 THYN1Q9P016 225 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.31□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM235A6NFC5 223 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TGOLN2O43493 480 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 AQP4P55087 323 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 GNG2P59768 71 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 MSMO1Q15800 293 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 GALNT14Q96FL9 552 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.3□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR4C46A6NHA9 309 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 UPK2O00526 184 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 CYB5BO43169 146 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TNFSF12O43508 249 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SSX5O60225 188 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 DEDDO75618 318 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SCGNO76038 276 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 HPRT1P00492 218 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 FGF2P09038 288 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPA2P15927 270 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TAS2R31P59538 309 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 POU2AF1Q16633 256 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 C22orf42Q6IC83 251 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 HERC2O95714 4834 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR2T8A6NH00 312 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NOTOA8MTQ0 251 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 K7EMT4 169 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SULT1C2O00338 296 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NDUFA4O00483 81 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 S1PR2O95136 353 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 NQO2P16083 231 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 FCGR2CP31995 323 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARPC4P59998 168 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 ATP6V0BQ99437 205 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC1-205ENST00000572656 SMIM30A4D0T7 59 aa7.27□□□□□ -1.25
TRAPPC1-205ENST00000572656 PPYP01298 95 aa7.27□□□□□ -1.25
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