RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.25□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 CXorf58Q96LI9 332 aa8.25□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.25□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF320A2RRD8 509 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 J3QRK9 145 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 UBE2CO00762 179 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TSPAN4O14817 238 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SPRY2O43597 315 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 HLA-GP17693 338 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TALDO1P37837 337 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 OR2B8PP59922 312 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 PMS2P11Q13670 270 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 CDNFQ49AH0 187 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 OR2C3Q8N628 320 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 OR4A5Q8NH83 315 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RNF183Q96D59 192 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.24□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DPPA5A6NC42 116 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SSX5O60225 188 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 HRASP01112 189 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB3BP20337 219 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 APOC4P55056 127 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 DEFB135Q30KP9 77 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF585BQ52M93 769 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF773Q6PK81 442 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 VCXQ9H320 206 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 SPATA2Q9UM82 520 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.23□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 F8W735 103 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 S1PR2O95136 353 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 REG1AP05451 166 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 GPR183P32249 361 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 AQP4P55087 323 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 NRG4Q8WWG1 115 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 GPHA2Q96T91 129 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP6V0BQ99437 205 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM235A6NFC5 223 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 UPK2O00526 184 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 TGOLN2O43493 480 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 TAS2R31P59538 309 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 PLET1Q6UQ28 207 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SSX9Q7RTT3 188 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 RYR1P21817 5038 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 NOTOA8MTQ0 251 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 K7EMT4 169 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 DEDDO75618 318 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SCGNO76038 276 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 DEFA4P12838 97 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 MYL9P24844 172 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 WT1-ASQ06250 92 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 CADM3Q8N126 398 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 GALNT14Q96FL9 552 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 THYN1Q9P016 225 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.2□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 NDUFA4O00483 81 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 HPRT1P00492 218 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 PPYP01298 95 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SERPINE2P07093 398 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 NQO2P16083 231 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 ADMP35318 185 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 MFAP2P55001 183 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 C22orf42Q6IC83 251 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.19□□□□□ -1.1
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms