RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	UPK2	O00526	184 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HPGDS	O60760	199 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	S1PR2	O95136	353 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DMA	P28067	261 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RORC	P51449	518 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TATDN3	Q17R31	274 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM140	Q9NV12	185 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD9	Q9P000	198 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		16.57	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DPPA5	A6NC42	116 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RLN1	P04808	185 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		16.56	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		16.55	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	F2R	P25116	425 aa		16.55	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM209B	Q5JX69	171 aa		16.55	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		16.55	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFB8	O95169	186 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF585B	Q52M93	769 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC140	Q96MF4	163 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RYR3	Q15413	4870 aa		16.54	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP5D1	E7EU14	171 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR31	O00270	319 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DHFR	P00374	187 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CADM3	Q8N126	398 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PEMT	Q9UBM1	199 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH11	A6NNE9	402 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y980	276 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	REG1A	P05451	166 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RCVRN	P35243	200 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR107	Q5VW38	600 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		16.53	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MZ25	164 aa		16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	RPA2	P15927	270 aa		16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH3B2	P48448	385 aa		16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MZT2A	Q6P582	158 aa		16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	AP3S1	Q92572	193 aa		16.52	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-23	P01764	117 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR6	P43657	344 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		16.51	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS9	O00182	355 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2C1	O95371	312 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFA4	P12838	97 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN5	P62079	268 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LCN12	Q6JVE5	192 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	GPHB5	Q86YW7	130 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N402	240 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200		S4R3C0	116 aa		16.5	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KRAS	P01116	189 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	UCP3	P55916	312 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-16	P61578	105 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	WT1-AS	Q06250	92 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK11	Q9UBX7	282 aa		16.49	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM25A	B3EWG3	89 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM25C	B3EWG5	89 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM25G	B3EWG6	89 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TPPP	O94811	219 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	G6PC	P35575	357 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD1	Q96SE0	405 aa		16.48	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf70	A6NJV1	201 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	EDN2	P20800	178 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL3	P36405	182 aa		16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	16.47	■□□□□ 0.23
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		16.47	■□□□□ 0.23

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