RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 NOXA1Q86UR1 476 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00311Q8N616 119 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RFESDQ8TAC1 157 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RPEQ96AT9 228 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HYLS1Q96M11 299 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 NMES1Q9C002 83 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.24□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 OOSP1A8MZH6 123 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 G3V3Q6 166 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 GOSR2O14653 212 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ELANEP08246 267 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A6P12236 298 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF137PP52743 207 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 FGL1Q08830 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CATR1Q13166 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IL15RAQ13261 267 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 FOXE3Q13461 319 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 UBALD1Q8TB05 177 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 TP53RKQ96S44 253 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 OR2D2Q9H210 308 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HERC2O95714 4834 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.23□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HMSDA8MTL9 139 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B6O14756 317 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 RAB29O14966 203 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PROP1O75360 226 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA21P01568 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGHG2P01859 326 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 VDAC1P21796 283 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF134P52741 427 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 FHL3Q13643 280 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HNF4GQ14541 408 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf50Q96LR7 162 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.22□□□□□ -1.25
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OVOL1O14753 267 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ST8SIA5O15466 376 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 MMP23AO75900 390 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A4P12235 298 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 S100A1P23297 94 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 GPR12P47775 334 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF616Q08AN1 781 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 NMSQ5H8A3 153 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM65Q6PI78 240 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 FAM219AQ8IW50 185 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 OR9G1Q8NH87 305 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 C5orf30Q96GV9 206 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ABHD14BQ96IU4 210 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PSG11Q9UQ72 335 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.21□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ADAP1O75689 374 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ATG12O94817 140 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SIX6O95475 246 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1D-33P01593 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-33P01594 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV1-47P01700 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SERPINE2P07093 398 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 PET100P0DJ07 73 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DS2P43631 304 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 SP6Q3SY56 376 aa7.2□□□□□ -1.26
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF585BQ52M93 769 aa7.2□□□□□ -1.26
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