RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 NUDT3O95989 172 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A16P16260 332 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 TCF23Q7RTU1 214 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A0G2JK05 382 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-208ENST00000550358 H3BRM9 83 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 NMBP08949 121 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1-33P01594 117 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRB-208ENST00000550358 WNT2P09544 360 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 ADIPOQQ15848 244 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 MDS2Q8NDY4 140 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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