RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 IGHV2-5P01817 119 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 GNB1P62873 340 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 STPG2Q8N412 459 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C17orf50Q8WW18 174 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 ARV1Q9H2C2 271 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TREM1Q9NP99 234 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CREBBPQ92793 2442 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZFHX3Q15911 3703 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 UPK2O00526 184 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ACTL6BO94805 426 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 HTR1DP28221 377 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 HES1Q14469 280 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZNF429Q86V71 674 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 VSIRQ9H7M9 311 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PRNDQ9UKY0 176 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 FGF2P09038 288 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SNCAP37840 140 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RAB13P51153 203 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 F2RL1P55085 397 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 BLOC1S1P78537 153 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TLE4Q04727 773 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PLGLAQ15195 96 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PDPNQ86YL7 162 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CA2P00918 260 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 REG1AP05451 166 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FGF7P21781 194 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PRTN3P24158 256 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 MC5RP33032 325 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 TMEM177Q53S58 311 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 DPM3Q9P2X0 92 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TENM4Q6N022 2769 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.79□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 NPY1RP25929 384 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 DEFA5Q01523 94 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 MLANAQ16655 118 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 LCN15Q6UWW0 184 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TNFRSF14Q92956 283 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FBXL15Q9H469 300 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 BET1LQ9NYM9 111 aa6.79□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 A8MXK9 166 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FAM157AC9JC47 383 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TOX4O94842 621 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CD1BP29016 333 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZNF137PP52743 207 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CCL20P78556 96 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 MMDQ15546 238 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TNXAQ16473 311 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 POU2AF1Q16633 256 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.79□□□□□ -1.32
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