RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 NUP205Q92621 2012 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 LINC01387J3KSC0 135 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 OR2H2O95918 312 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 DEFB103AP81534 67 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 K7EP13 123 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SELLP14151 372 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE5Q13069 117 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE6Q13070 117 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1B0GUL6 1792 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PEX11BO96011 259 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C3orf79P0CE67 100 aa7.36□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 FCN3O75636 299 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PLNP26678 52 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 R4GN57 208 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-48P01763 117 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TSPAN7P41732 249 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PLAURQ03405 335 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 NPIPB3Q92617 1050 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SCN4AP35499 1836 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 UPK3AO75631 287 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CCL20P78556 96 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 H3BMM0 161 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 UBE2WQ96B02 151 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 OTOFQ9HC10 1997 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GREM1O60565 184 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 AGFG2O95081 481 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PCSK4Q6UW60 755 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.35□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C9orf118A6NHY6 69 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 Q6AWC8 147 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C1RLQ9NZP8 487 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 RNF7Q9UBF6 113 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CD27P26842 260 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF146Q15072 292 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GATD1Q8NB37 220 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 AMELYQ99218 206 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 C9JCJ5 164 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CDKN1AP38936 164 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 LIMS1P48059 325 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PRRT4C9JH25 899 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 NDUFC2O95298 119 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 VEGFBP49765 207 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE12JA6NER3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 VWC2LB2RUY7 222 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 WNT9BO14905 357 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 SPINT1O43278 529 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE7O76087 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE12FP0CL80 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE12GP0CL81 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE12IP0CL82 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GNG5P63218 68 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE4Q13068 117 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 ZAR1Q86SH2 424 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 OCC1Q8TAD7 63 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM126AQ9H061 195 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 CSTL1Q9H114 145 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.34□□□□□ -1.23
ATXN3-216ENST00000545170 PCM1Q15154 2024 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 TOMM40O96008 361 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 ASIPP42127 132 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 GUSBP11Q6P575 273 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.34□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 ZIC1Q15915 447 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 TEX45Q8NA69 505 aa7.33□□□□□ -1.24
ATXN3-216ENST00000545170 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms