RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 NDUFB8O95169 186 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR2C1O95371 312 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 MYOD1P15172 320 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 AREGP15514 252 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HLA-DMAP28067 261 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GNRHRP30968 328 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TAS2R46P59540 309 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 VBP1P61758 197 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 NCS1P62166 190 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 Q8N1Y9 231 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 Q8N402 240 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM25AB3EWG3 89 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM25CB3EWG5 89 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM25GB3EWG6 89 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 UPK2O00526 184 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 KRASP01116 189 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RLN1P04808 185 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CRYGCP07315 174 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ARL3P36405 182 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 LPAR6P43657 344 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 RORCP51449 518 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ERVK-16P61578 105 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TMEM140Q9NV12 185 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 THYN1Q9P016 225 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GW64 132 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 C3orf84H3BNL1 204 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GPR31O00270 319 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CYB5BO43169 146 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HPGDSO60760 199 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SNAPC5O75971 98 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 S1PR2O95136 353 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 APOA1P02647 267 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CLEC3BP05452 202 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 FOLR2P14207 255 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CTRB1P17538 263 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 NAT1P18440 290 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 F2RP25116 425 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 S100GP29377 79 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HRH1P35367 487 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR2B8PP59922 312 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GUCA2BQ16661 112 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 MZT2AQ6P582 158 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 GPHB5Q86YW7 130 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 MOB3AQ96BX8 217 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CXorf58Q96LI9 332 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 CMTM3Q96MX0 182 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 HINT2Q9BX68 163 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 COMMD9Q9P000 198 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-222ENST00000540445 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 C2orf70A6NJV1 201 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 CGB1A6NKQ9 187 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 MARCH11A6NNE9 402 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 A8MZ25 164 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 LGALS9O00182 355 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 OR13C7P0DN81 318 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 ELK1P19419 428 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 CBLN1P23435 193 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 G6PCP35575 357 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 CD81P60033 236 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 POU2AF1Q16633 256 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 PLET1Q6UQ28 207 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-222ENST00000540445 GPX8Q8TED1 209 aa6.83□□□□□ -1.32
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