RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFCAB9A8MZ26 197 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WRBO00258 174 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QAP02745 245 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRYGAP11844 174 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL4P13236 92 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RCVRNP35243 200 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLDN8P56748 225 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSTNP60981 165 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB31Q13636 194 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMMD1Q8N668 190 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4A15Q8NGL6 344 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6N2Q8NGY6 317 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SFT2D1Q8WV19 159 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR7D2Q96RA2 312 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COPS4Q9BT78 406 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFT46Q9NQC8 304 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASL12Q9NYN1 266 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STMN3Q9NZ72 180 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMC3Q9P0I2 261 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP45Q9UL16 551 aa-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-1.22□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN13Q12923 2485 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BSNQ9UPA5 3926 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 hCG_2039718K7EN88 272 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCL16O15467 120 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FABP7O15540 132 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYTH3O43739 400 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL6IP5O75915 188 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-7P01780 117 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADORA1P30542 326 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FXYD6P3P58550 94 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RHOGP84095 191 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00471Q8N535 108 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF321PQ8N8H1 164 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6K2Q8NGY2 324 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8WTZ3 238 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIB1Q99828 191 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYT4Q9H2B2 425 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXO5Q9H790 373 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX24Q9Y343 169 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMA5O15230 3695 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCL9O00512 1426 aa-1.23□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUPR1O60356 82 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBL3O95164 117 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCL1BO95988 128 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HBZP02008 142 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLA-DQB2P05538 268 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RANBP1P43487 201 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DAD1P61803 113 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL18Q14116 193 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10J3Q5JRS4 329 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSX8Q7RTT4 187 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYS1Q8N2H4 156 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM251Q8N6I4 163 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4D11Q8NGI4 311 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf40Q8WZ69 217 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD7Q92527 254 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A6EQ96DS6 147 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMBIM4Q9HC24 238 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XAGE1AQ9HD64 81 aa-1.24□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCN3AQ9NY46 2000 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA8RI6L899 631 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAAHO00519 579 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX7A2LO14548 114 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LY6G6CO95867 125 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REG1AP05451 166 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP5G1P05496 136 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMD7P51665 324 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BEX3Q00994 111 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNA13Q14344 377 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PID1Q7Z2X4 250 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARL17AQ8IVW1 177 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NATD1Q8N6N6 113 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HINT2Q9BX68 163 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB1BQ9H0U4 201 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO44Q9H4M3 255 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSTPIP2Q9H939 334 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPCAL4Q9UM19 191 aa-1.25□□□□□ -2.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRELID1Q9Y255 219 aa-1.25□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms