RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514421.1

CCL28-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 3

Gene CCL28, Length 577 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-204ENST00000514421 MOB3BQ86TA1 216 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 FAM219AQ8IW50 185 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 BAP18Q8IXM2 172 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 OR8U1Q8NH10 309 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 LINC01006Q8NI28 216 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 C5orf30Q96GV9 206 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 ZNF747Q9BV97 191 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 A0A1W2PPI3 338 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 TIMM23O14925 209 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 SPDEFO95238 335 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 IGKV1-5P01602 117 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 SERPINE2P07093 398 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 CD24P25063 80 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 ZNF137PP52743 207 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 GNMTQ14749 295 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 AARDQ4LEZ3 155 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 TMEM219Q86XT9 240 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 LYG1Q8N1E2 194 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 RNF114Q9Y508 228 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL28-204ENST00000514421 A0A0G2JRQ6 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RAB29O14966 203 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 TXNL1O43396 289 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 KCNAB3O43448 404 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 TNFSF12O43508 249 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CHST1O43916 411 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 PROP1O75360 226 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 JTBO76095 146 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CD1BP29016 333 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 REG1BP48304 166 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 TAS2R30P59541 319 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 S100A10P60903 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 BLCAPP62952 87 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 EBI3Q14213 229 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 HNF4GQ14541 408 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CFHR4Q92496 578 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 GPR146Q96CH1 333 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 GPHA2Q96T91 129 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 S1PR3Q99500 378 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 OR2D2Q9H210 308 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 M0QZK8 103 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 ST8SIA5O15466 376 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 ATG12O94817 140 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 IGKV1D-33P01593 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 IGKV1-33P01594 117 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 FGF2P09038 288 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 TMEM11P17152 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 PAX9P55771 341 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 BAXQ07812 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CATR1Q13166 79 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 HES1Q14469 280 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 Q6ZRM9 215 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 Q8N2B8 174 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 STPG2Q8N412 459 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 OR2C3Q8N628 320 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 OR51H1Q8NH63 302 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 DDB2Q92466 427 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RAB40CQ96S21 281 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 FBXL17Q9UF56 701 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 RNF150Q9ULK6 438 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL28-204ENST00000514421 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms