RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 C3orf56Q8N813 242 aa8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.79□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 C15orf61A6NNL5 157 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 IFNA21P01568 189 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 COMMD1Q8N668 190 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 SLC35G3Q8N808 338 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 LRTM2Q8N967 370 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 OR5B3Q8NH48 314 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.78□□□□□ -1
ITGA3-210ENST00000507771 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 MSGN1A6NI15 193 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 LINC01548A6NM66 108 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 CYB5BO43169 146 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 IFNA17P01571 189 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 IGKV1-5P01602 117 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OPN1MWP04001 364 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 IL5P05113 134 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR9G9P0C7N8 305 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 PROK1P58294 105 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR2B8PP59922 312 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TEX38Q6PEX7 206 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM65Q6PI78 240 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 LFNGQ8NES3 379 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 LHFPL5Q8TAF8 219 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 HINT2Q9BX68 163 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ENY2Q9NPA8 101 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 PRR13Q9NZ81 148 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 NSG2Q9Y328 171 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.77□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1B0GU03 582 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1W2PN81 502 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 HOXB5P09067 269 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 CHRNA7P36544 502 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 NDPQ00604 133 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF429Q86V71 674 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 MITD1Q8WV92 249 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 CACNG5Q9UF02 275 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 G3V318 75 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 FBXO24O75426 580 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ELANEP08246 267 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 P0C879 139 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SMCO1Q147U7 214 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF329Q86UD4 541 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 OR1S1Q8NH92 325 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 GPR146Q96CH1 333 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF747Q9BV97 191 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 COA4Q9NYJ1 87 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ITGA3-210ENST00000507771 A0A0B4J293 547 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms