RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 CSTL1Q9H114 145 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 TENM2Q9NT68 2774 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PP11 408 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2QL1A1L167 161 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 MPTX1A8MV57 137 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 MFNGO00587 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 C15orf32Q32M92 178 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 XAF1Q6GPH4 301 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF773Q6PK81 442 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 VSIRQ9H7M9 311 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 M0R1X1 148 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 TGOLN2O43493 480 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 OR5T1Q8NG75 326 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 PHB2Q99623 299 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 FAAP24Q9BTP7 215 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-210ENST00000503258 FCGR3AP08637 254 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 CD36P16671 472 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SOX2P48431 317 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SPARTQ8N0X7 666 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 Q8NAQ8 132 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 OR10J5Q8NHC4 309 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0A6YYH2 397 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 A6NJ64 397 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 VAMP1P23763 118 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 MED22Q15528 200 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 KMT2AQ03164 3969 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ARL6IP5O75915 188 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-GP17693 338 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM50BP56557 158 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 MAJINQ3KP22 176 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 CNIH2Q6PI25 160 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 MND1Q9BWT6 205 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 SMPXQ9UHP9 88 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 LALBAP00709 142 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 OR2B8PP59922 312 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 TNXAQ16473 311 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 BANF2Q9H503 90 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 PDCD5O14737 125 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 TM4SF20Q53R12 229 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 IGSF11Q5DX21 431 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 FUNDC2Q9BWH2 189 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 CGB1A6NKQ9 187 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 J3QRK9 145 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-210ENST00000503258 UPK2O00526 184 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms