RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489789.3

CNTNAP3B-209, Transcript of contactin associated protein like 3B, human

TSL 5

Gene CNTNAP3B, Length 501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HRAS	P01112	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IFNA5	P01569	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NMB	P08949	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FGF2	P09038	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CD24	P25063	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SSTR5	P35346	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	THBS3	P49746	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CAV2	P51636	162 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RAB2A	P61019	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MORN2	Q502X0	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		Q6ZSV7	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	STPG2	Q8N412	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A1W2PPE3	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TXNL1	O43396	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TNFSF12	O43508	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SSSCA1	O60232	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TSPAN9	O75954	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	APOA2	P02652	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CGB3	P0DN86	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CGB7	P0DN87	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	NQO2	P16083	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LPAR6	P43657	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	GNG10	P50151	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SULT1A1	P50225	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	F2RL1	P55085	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	DLX6	P56179	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ATP5S	Q99766	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		A0A1B0GUS0	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789		M0R1X1	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	FGF16	O43320	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	CHST1	O43916	411 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNTNAP3B-209	ENST00000489789	ZP3	P21754	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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