RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6D	Q14210	128 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPH5	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NNC1	897 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		H0YJW9	148 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		J3QR06	171 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CST7	O76096	145 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HRAS	P01112	189 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IFNA5	P01569	189 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IAPP	P10997	89 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL3L1	P16619	93 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	COL8A2	P25067	703 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SNCA	P37840	140 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PLA2G5	P39877	138 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00205	P59089	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	FHL2	Q14192	279 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CLINT1	Q14677	625 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LTC4S	Q16873	150 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZRG5	221 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ATRX	P46100	2492 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BP45	60 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R1W7	72 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	UPK2	O00526	184 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	MPDU1	O75352	247 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	HBE1	P02100	147 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	APOA2	P02652	100 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SOD3	P08294	240 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	NFYB	P25208	207 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	IL3RA	P26951	378 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMLG	P49069	296 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB13	P51153	203 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	DLK1	P80370	383 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TLE4	Q04727	773 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8N7P7	452 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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