RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 GPHA2Q96T91 129 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ATG5Q9H1Y0 275 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATA2Q9UM82 520 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 UBR4Q5T4S7 5183 aa7□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CGB1A6NKQ9 187 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 XRCC3O43542 346 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 DHFRP00374 187 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC3BP05452 202 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CTXN2P0C2S0 81 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf88P0DMB2 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-GP17693 338 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CRHBPP24387 322 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 MYL9P24844 172 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR183P32249 361 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFRSF9Q07011 255 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL6IP1Q15041 203 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 HACD4Q5VWC8 232 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4A47Q6IF82 309 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CNIH2Q6PI25 160 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX9Q7RTT3 188 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 MARC2Q969Z3 335 aa6.99□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM30A4D0T7 59 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM235A6NFC5 223 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SPRY2O43597 315 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX5O60225 188 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFA4P12838 97 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB3BP20337 219 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 GALP22466 123 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 BMI1P35226 326 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB135Q30KP9 77 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF585BQ52M93 769 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZWC4 215 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 MFSD4AQ8N468 514 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 NRG4Q8WWG1 115 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 CXorf58Q96LI9 332 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.98□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFSF12O43508 249 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 HRASP01112 189 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 APOC4P55056 127 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2B8PP59922 312 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 C22orf42Q6IC83 251 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2C3Q8N628 320 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 BET1LQ9NYM9 111 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.97□□□□□ -1.29
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2CO00762 179 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 S1PR2O95136 353 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PTHLHP12272 177 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.32e-22■■■■■ 51.6
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG2P59768 71 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 PLET1Q6UQ28 207 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4A5Q8NH83 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF183Q96D59 192 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 NOTOA8MTQ0 251 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 SULT1C2O00338 296 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 UPK2O00526 184 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN4O14817 238 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-210ENST00000481231 RTL8CO15255 209 aa6.95□□□□□ -1.3
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