RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 DVL1O14640 695 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MT-ND4LP03901 98 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RAB5AP20339 215 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 AGAP20933 346 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CD81P60033 236 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RNF212Q495C1 297 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TREML4Q6UXN2 200 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 OR52E5Q8NH55 327 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TVP23CQ96ET8 276 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 C1orf159Q96HA4 380 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF714Q96N38 554 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TUBA4BQ9H853 241 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RAB9BQ9NP90 201 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 VAX2Q9UIW0 290 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SIAH2O43255 324 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 YIF1AO95070 293 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CXCL1P09341 107 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 FAM209BQ5JX69 171 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 YPEL4Q96NS1 127 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MGST2Q99735 147 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CCL21O00585 134 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFB3O43676 98 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CA2P00918 260 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MIC13Q5XKP0 118 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MOB3BQ86TA1 216 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 NIT2Q9NQR4 276 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 NGBQ9NPG2 151 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ABCA4P78363 2273 aa7.24□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 IFITM10A6NMD0 228 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 VSTM5A8MXK1 200 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SOX15O60248 233 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 PAGE4O60829 102 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 HRASP01112 189 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CD3EP07766 207 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MLANAQ16655 118 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 Q8WTZ3 238 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 SSX3Q99909 188 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TPRP12270 2363 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 J3QR06 171 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 UPK2O00526 184 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 LY6HO94772 140 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV2-5P01817 119 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 MBP02144 154 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 NPY1RP25929 384 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CHRNB4P30926 498 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 CA7P43166 264 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2G2P60604 165 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ELOBQ15370 118 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 OR4F5Q8NH21 305 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 OR4F4Q96R69 305 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.23□□□□□ -1.25
CDHR3-211ENST00000478080 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms